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    JACS|把“環肽合成”帶入分鐘時代:CycloBot 自動化平臺重塑化學合成范式

    來源:化學加APP      2025-12-23
    導讀:近日,浙江大學李承喜教授團隊在Journal of the American Chemical Society(JACS)上發表研究論文 “Automated Rapid Synthesis of High-Purity Head-to-Tail Cyclic Peptides via a Diaminonicotinic Acid Scaffold”,報道了一種全自動、分鐘級、高純度的環肽合成新范式,為環肽藥物的快速發現與規模化制備提供了關鍵技術支撐。
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    那么,為什么“環肽”如此重要,卻又始終被認為“難做”?

    環肽兼具小分子的合成可控性與大分子的結構剛性和高親和力,在抗菌、抗腫瘤、免疫調節等多個方向展現出獨特優勢。目前,全球已上市的多肽藥物中,約44% 為環肽,其在藥物研發中的地位不言而喻。然而,在化學合成層面,環肽長期面臨難以回避的現實挑戰。頭尾環化(head-to-tail cyclization) 是整個合成過程中最具難度的關鍵步驟。傳統方法往往依賴高稀釋條件和冗長反應時間,操作流程高度依賴人工經驗;同時,環化效率對肽序列與環尺寸極其敏感,常伴隨消旋、副反應以及產物純度不可控等問題。結果是,環肽在應用層面“很好用”,但在合成層面卻始終“不好做”

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    1. 一個“聰明”的連接子:讓環肽合成“一鍵”完成

    本項工作的真正突破,并不只是速度上的提升,而是實現了從分子設計到系統工程的整體重構:一個“聰明”的連接子,配合一臺真正“會思考”的自動化合成機器人,共同改變了環肽合成的底層邏輯。研究團隊首先設計了一種全新的二氨基煙酸(DAN)連接子。該連接子通過精細的結構設計,使兩個氨基在反應中承擔不同功能:一個用于肽鏈延伸,另一個專門用于環化激活。引入的吡啶結構有效調控了反應活性,避免了雙重酰化等副反應,使得在溫和條件下即可實現“一鍵式”的同步環化與從樹脂釋放。得益于這一設計,反應副產物極少,粗品純度可直接超過 95%。這也意味著,長期依賴經驗與“手感”的環化步驟,首次轉變為可預測、可程序化的化學過程。

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    2. 把環肽合成交給機器人:CycloBot 自動化平臺

    在此基礎上,團隊進一步構建了全自動流動化學平臺CycloBot。該平臺能夠在分鐘尺度內完成從氨基酸到環肽的完整合成流程,并由自主開發的軟件AutoXpert實現對偶聯、脫保護與環化過程的實時監控。在典型案例中,一個六肽環肽可在 24 分鐘內完成合成,收率達 93%,粗品純度超過 95%。更重要的是,該平臺對底物具有高度通用性,能夠兼容天然與非天然氨基酸、N-甲基化修飾、熒光標記以及點擊化學基團。一句話概括,CycloBot 將原本“手工藝型”的環肽合成,真正轉化為數字化、自動化的分子智造過程

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    3. 從 4 天到 27 分鐘:效率躍遷且幾乎無消旋

    這項工作的說服力,最終體現在系統級驗證上。與傳統CTC 樹脂法相比,完整合成時間從 4 天縮短至 27 分鐘,幾乎不發生消旋(d.r. 可達 >99:1),適用的環尺寸覆蓋 2–13 個氨基酸。更具示范意義的是,平臺可在 1 天內自動合成 20 元環肽庫并直接進入生物篩選,其中篩選得到的抗菌環肽對 S. aureus 和 B. subtilis 的活性相比青霉素提升了約 100 倍。這意味著,“合成”不再是環肽藥物研發的瓶頸,分子設計、自動化合成與功能篩選首次真正進入高速閉環

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    4. 跨環尺寸與序列空間的通用環肽合成能力

    從更宏觀的角度看,CycloBot的意義不僅在于一臺好用的設備,更釋放出一個清晰信號:化學正在加速邁入“自動化+智能化”的新階段。合成研究正從關注單一反應,轉向系統工程與流程設計;從“人盯反應”,轉向軟件驅動與實時監控;從單分子優化,走向高通量、可規模化的分子制造。而這,正是未來個性化藥物開發、AI分子設計與快速臨床轉化所迫切需要的底層技術基礎。

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    5. 從自動化合成到功能篩選的環肽發現閉環


    關于研究團隊

    本研究由浙江大學李承喜教授團隊完成。李承喜博士為浙江大學“百人計劃”研究員,化學工程與生物工程學院博士生導師、制藥研究所副所長,兼聘浙江大學杭州國際科創中心,入選國家高層次人才計劃。團隊長期聚焦于環肽及多肽分子的精準化學構建、新型連接子與環化策略開發,以及自動化、流動化與智能化合成平臺的系統集成,致力于推動復雜分子合成從“經驗驅動”向“可程序化、可規模化”的醫藥智造范式轉變。

    課題組主頁:https://person.zju.edu.cn/chengxili


    文獻詳情:

    Wan, F.; Hu, C. R.; Xie, P.; Yang, X. X.; Pan, Y. R.; He, X.; Ning, Z.; Li, C.*; Automated rapid synthesis of high-purity head-to-tail cyclic peptides via a diaminonicotinic acid scaffold. J. Am. Chem. Soc.2025, https://doi.org/10.1021/jacs.5c16902


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